Юрий Брагин возвращается в Санкт-Петербург и продолжает службу в Следственном комитете. Вместе с другом Михаилом Шибановым из уголовного розыска он расследует убийства, исчезновения, коррупционные преступления и дела, в которых подозреваемые пытаются скрыть следы или переложить вину на других. Жена Брагина Вера работает адвокатом и порой оказывается связана с его расследованиями как защитник участников уголовных дел.
Брагин и Шибанов берутся за резонансные преступления в Петербурге и области, сталкиваясь с криминальными группами, чиновниками, бывшими военными и людьми, скрывающими давние дела. Одно расследование затрагивает Веру: ее обвиняют в двойном убийстве, совершенном более двадцати лет назад.
В пятом сезоне Веру освобождают, но обстоятельства давнего преступления остаются неясными. Брагин рассчитывает вернуться в СК, однако его место уже занято. Он становится следователем районного отдела Петербурга, где получает старые нераскрытые дела и выясняет, что произошло с работавшим здесь до него следователем.